標本號 | 科號 | 科名 | 科中文名 | 學名 | 中文名 |  |
| NTHUB02745 | F172 | Osmeridae | 胡瓜魚科 | Plecoglossus altivelis altivelis | 香魚 | |
| NTHUB02746 | F102 | Cyprinidae | 鯉科 | Carassius cuvieri | 高身鯽 | |
| NTHUB02747 | F102 | Cyprinidae | 鯉科 | Zacco pachycephalus | 粗首鱲 | |
| NTHUB02760 | F102 | Cyprinidae | 鯉科 | Sinibrama macrops | 大眼華鯿 | |
| NTHUB02772 | F399 | Terapontidae | 鯻科 | Terapon jarbua | 花身鯻 | |
| NTHUB02773 | F457 | Eleotridae | 塘鱧科 | Eleotris acanthopoma | 塘鱧 | |
| NTHUB02794 | F460 | Gobiidae | 鰕虎科 | Rhinogobius giurinus | 極樂吻鰕虎 | |
| NTHUB02797 | F460 | Gobiidae | 鰕虎科 | Rhinogobius candidianus | 明潭吻鰕虎 | |
| NTHUB02809 | F106 | Cobitidae | 鰍科 | Cobitis sinensis | 中華花鰍 | |
| NTHUB02826 | F378 | Sparidae | 鯛科 | Acanthopagrus schlegelii | 黑鯛 | |
| NTHUB03006 | F107 | Balitoridae | 平鰭鰍科 | Sinogastromyzon puliensis | 埔里中華爬岩鰍 | |
| NTHUB03007 | F102 | Cyprinidae | 鯉科 | Paracheilognathus himantegus | 革條副鱊 | |
| NTHUB03008 | F455 | Rhyacichthyidae | 溪鱧科 | Rhyacichthys aspro | 溪鱧 | |
| NTHUB03009 | F107 | Balitoridae | 平鰭鰍科 | Hemimyzon formosanum | 台灣間爬岩鰍 | |
| NTHUB03016 | F102 | Cyprinidae | 鯉科 | Microphysogobio alticorpus | 高身小鰾鮈 | |
| NTHUB03018 | F102 | Cyprinidae | 鯉科 | Microphysogobio alticorpus | 高身小鰾鮈 | |
| NTHUB03020 | F102 | Cyprinidae | 鯉科 | Microphysogobio alticorpus | 高身小鰾鮈 | |
| NTHUB03021 | F460 | Gobiidae | 鰕虎科 | Rhinogobius candidianus | 明潭吻鰕虎 | |
| NTHUB03022 | F102 | Cyprinidae | 鯉科 | Zacco pachycephalus | 粗首鱲 | |
| NTHUB03023 | F107 | Balitoridae | 平鰭鰍科 | Sinogastromyzon puliensis | 埔里中華爬岩鰍 | |
